鱼塘经过一年或多年的养殖之后，底质由于鱼的粪便、残剩饵料、死鱼和动植物尸体、有机肥料等的不断积累，各种有害的病原菌和寄生虫大量潜伏于淤泥中，在池底形成一定厚度的淤泥。在养殖过程中，这些病原菌和寄生虫就会大量繁殖，并感染鱼体，对鱼类的生长和生存造成极大的威胁。水体中大量腐殖质及有机物的不断分解氧化，会使池塘下层水中的氧消耗殆尽，造成底部缺氧，继而造成池塘水缺氧，加大饵料系数，引起部分鱼浮头，影响鱼的生长，浮头严重时会导致“泛塘”，引起死鱼事故的发生，给池塘养殖带来惨重的经济损失。
    清塘主要包括清理塘泥、清除杂草、修整池埂等，通过清塘可以清除池塘中潜伏的大部分细菌、寄生虫病原体，减少鱼病的发生；还可杀灭螺、蚌等，切断病原菌传播路线；清塘后通过曝晒塘底，有利于清除有害化学物质而使底质得到了改良，改善鱼的生存环境。由此可见，清塘对鱼病防治具有较大的作用。