该项目在全面地对我国豆科植物结瘤情况进行调查和根瘤采集的基础上，系统地对根瘤菌多样性、分类和系统发育进行了研究。
    先后组织全国20个省(直辖市)的微生物学工作者100余人，完成了全国32个省(包括台湾部分地区)近700个县不同生态地点的根瘤菌资源调查，采集根瘤标本近7 000份，包括豆科植物100多属、 600多种，新发现结瘤植物300多种；分离、纯化、确认、保藏根瘤菌5 000多株，其数量和所属寄主种类居世界首位。建立现代细菌分类实验室，装备一整套先进分析技术设施及计算机程序，并制定一套有效的根瘤菌分类、鉴定技术，对近2 000株菌进行了100多项表型和遗传型性状分析与分类研究，发现了一批分别耐酸(pH3.8)、耐碱(pH11)、耐盐(NaCl)、耐高温(40℃)、耐低温(4℃)生长的珍贵根瘤菌种质资源，这些抗逆性高于国际上所报道的。描述并发表根瘤菌新属2个，新种7个，占1984年以来国际上所发表的新属的1／2，新种的1／3，还完成了7个新种的研究。简称根瘤菌资源数据库，其菌株数量大、性状多、信息全面是国内外所没有的。通过对大量菌株的性状、寄主种类及其生态环境因素的综合分析，获得对豆科植物一根瘤菌共生关系的新认识，否定了传统的根瘤菌“寄主专一性”和植物“互接种族”概念，并提出根瘤菌接种选种的新见解。
    该项研究共发表科学论文64篇(国外12篇)，SCI收录11篇，并引用185次，在国际上影响很大。